1927年我国留德古生物学者孙云铸、杨钟健在德磋商成立中国古生物学会，起草章程12条，并函询国内外同行意见。1929年8月31日，我国第一代古生物学家10人在北平中信堂召开创立大会，孙云铸任会长，丁文江、葛利普、杨钟健、计荣森、李四光、赵亚曾、王恭睦、俞建章、乐森珣为首届理事会理事。学会成立后，因经费困难而陷于停顿状态。1947年12月25日在南京中央研究院地质研究所召开中国古生物学会复活大会。新中国成立后，学会于1951年3月经中央人民政府内务部核准登记。1956年6月在北京召开了学会第一届会员代表大会。原业务主管单位是中国科学院，1959年8月加入中国科协，1979年7月加入国际中国古生物学会