原名中华麻风救济会，1926年1月在上海成立。主要发起人为邝富灼、李元信等，第一届会长为李元信；第二届会长颜福庆；第三届会长刁信德。（建国前的人员请核实）抗日战争时期停止活动。1954年3月，中华麻风救济会更名为“中华麻风防治协会”。1985年3月，在卫生部顾问马海德博士的倡议下，经国家体改委批准恢复成立，同时加入中国科协。同年8月10—12日在广东顺德召开第一次全国会员代表大会。新中国成立初期，学会由中央人民政府卫生部及内务部领导。因会址设在上海市，由华东行政委员会卫生局、民政局代管。1985年3月恢复成立后，由卫生部主管。1950年8月，全国科联成立，第一批加入科联。协会会址设在北京，历届理事长为：马海德、陈敏章、叶干运、肖梓仁、王立忠、张国成，目前为第七届理事会。