扎兰屯市科协为正科级群众团体，经费实行财政全额拨款，独立财政预算；科协主席为法人代表。内设机构4个，即办公室、组织宣传部、科技普及部、学会学术部。2020年6月经市委批准成立了科协党组，科协主席为党组书记。截止2020年7月，科协现有编制6名，正式在编人员6人，主席、副主席各1名。 具体职能职责包括： （一）贯彻落实党和国家有关科技发展的方针政策、法律法规，研究制定全市科学技术协会工作计划，并组织实施。 （二）开展经常性、群众性、社会性科普工作，推进学术交流、创新创业、人才成长、决策咨询等创新体系建设。 （三）依照《中国科学技术协会章程》开展工作。对所属专业学会进行管理，指导基层科协加强组织建设，促进企业、高校科技进步和创新。 （四）组织指导所属专业学会承接科技评估、国家科技奖励推荐等工作。发现和培养杰出青年科学人才和创新团队，表彰奖励优秀科学技术工作者。 （五）组织开展科学技术合作与交流活动，加强与各有关科技组织、科技团体和科技界人士的友好往来。 （六）加强对科技工作者的政治引领，反映科技工作者的合理意见和建议，维护科技工作者合法权益。 （七）完成市委、市政府和上级业务部门交办的其它工作。