前身是1980年11月成立的中国轻工业协会食品学会。1984年9月，参加国际食品科技联盟（InternationalUnionofFoodScienceandTechnology，IUFoST），成为正式成员，是中国食品科技界在国际食品科学技术联盟中的唯一代表。由贺志华、张学元、尹宗伦、秦含章等食品工业领域著名专家发起。1985年3月经中国科协、国家体改委批准成立，同年加入中国科协。第一届理事长为贺志华。原业务主管单位为中国轻工业部（现中国轻工业联合会）。学会会址设在北京，历届理事长为贺志华、潘蓓蕾、孟素荷，目前为第六届理事会。