蔡国军教授系全国百篇优秀博士论文获得者、教育部新世纪优秀人才、江苏省杰出青年基金获得者、江苏省“六大人才高峰”高层次人才计划、江苏省“333”中青年学术技术带头人。现任南京土木建筑学会常务理事兼秘书长、国际土力学与岩土工程学会会员、国际土力学及岩土工程学会原位测试专业委员会(TC102)核心委员、国际工程地质与环境协会(IAEG)会员、美国交通研究委员会(TRB)委员、中国公路学会青年专家委员会常务委员、中国岩石力学与工程学会地下工程分会理事、中国岩石力学与工程学会工程安全与防护分会理事、中国岩石力学与工程学会岩土工程信息技术与应用分会理事、中国土木工程学会土力学及岩土工程分会青年工作委员会委员、土工测试专业委员会委员、中国地质学会工程地质专业委员会青年工作委员会委员、中国振动工程学会土动力学专业委员会委员、中国岩石力学与工程学会青年工作委员会委员、中国岩石力学与工程学会环境岩土分会青年工作委员会委员、江苏省岩土力学与工程学会理事、江苏省环境科学学会土壤与地下水修复专业委员会委员。担任国际权威杂志《Journal of Geotechnical and Geoenvironmental Engineering》、《Canadian Geotechnical Journal》、《Geotechnical Testing Journal》、《International Journal of Geomechanics》、《Journal of Materials in Civil Engineering》、《Engineering Geology》、《Soils and Foundations》,国内核心期刊《岩土工程学报》等论文审稿人。
近年来紧密围绕现代岩土原位测试理论与应用技术(CPTU)方面,先后发表学术论文120余篇,其中第1作者/通讯作者SCI收录50篇、EI收录70篇,SCI论文他引200余次,单篇最高SCI他引20次。已获授权国家发明专利35项,国际PCT专利申请1项,实用新型专利16项,计算机软件著作权12项。出版专著2部,参编国外专著1部。主编首批国家社团(中国土木工程学会)标准1部、江苏省工程建设标准与地方标准2部,参编国家行业标准2部。2012年获全国百篇优秀博士论文奖,2015年江苏省科学技术奖一等奖(排2),2016年第十一届中国公路青年科技奖,2014年第八届中国岩石力学与工程学会青年科技奖金奖,2013年第十四届中国地质学会青年地质科技奖-银锤奖,2008-2010年度中国建筑学会优秀学术论文一等奖(排1),2015年南京市第十一届自然科学优秀学术论文二等奖(排1)。