一种识别环境水体中MIB产嗅藻种类的方法
成果类型:: 发明专利
发布时间: 2023-11-06 14:56:53
本发明一种识别环境水体样品中MIB产嗅藻种类的方法,本发明方法将水体中的细胞与丙烯酰胺反应,制成单细胞凝珠;接着进行细胞溶解处理后,再依次进行融合PCR、Block PCR、巢式PCR反应,并对巢式PCR反应产物进行基因测序,将测序结果与NCBI数据库进行比对,获知水体中携带产MIB的mic基因的藻类的种类。本发明方法通过对mic基因及16S rRNA基因引物的选择及扩增条件的优化,建立针对MIB产嗅藻的单细胞融合PCR方法,本发明方法可以在未培养的单细胞中实现mic功能基因与系统发育基因的连接,并且通量高,成本低,能精准识别环境样品中全部产嗅藻,且可特异性地识别环境样品中产嗅藻。
1、本发明选择的特异性引物经测序验证可以用于MIB产嗅藻的精准识别。2、本发明方法在我国青草沙水库环境样品中应用,测序结果表明该方法可以实现功能基因(mic基因)与16S基因的连接,达到识别MIB产嗅藻的目的。3、相比于纯藻分离鉴定及宏基因方法,该方法成本低,通量高,可以实现环境样品中MIB产嗅藻的精准识别。
传统的鉴别水体中的产MIB蓝藻的方法为纯藻分离培养及MIB检测,由于水体中蓝藻种类众多且存在不可培养的藻种,该方法随机性较大,成功率低,鉴别结果的准确性差,基本无法实现将环境样品中全部蓝藻进行分离并鉴定MIB产生情况。宏基因组测序研究对象仅为优势物种,不适用于通常不成为优势物种的产嗅藻。
而由于本发明方法是在未培养的细胞中连接mic基因和系统发育基因,不受限于细胞是否可培养,可以用于识别全部MIB产嗅藻,应用前景广阔。
实验室固定人员总数为80人,包括中国工程院院士2名,国家杰出青年基金获得者6名,并建有国家基金委“环境微界面过程与污染控制”创新研究群体(2013年进入创新三期)。
本发明方法基于单细胞融合PCR技术,精准识别环境水体中MIB产嗅藻,克服了藻种分离无法做到识别全部MIB产嗅藻,宏基因方法无法进行稀有物种功能基因的宿主识别的技术缺陷,可以在单细胞中实现mic功能基因与系统发育基因的连接,并且通量高,成本低,能实现环境样品中全部MIB产嗅藻的精准识别。
本科技成果支持技术转让,服务等多种方式,有针对性进行指导转化