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基于贪心算法的两个基因组比较分析系统

成果类型:: 软件著作权

发布时间: 2023-10-25 17:10:33

科技成果产业化落地方案
方案提交机构:“科创中国”蔬菜数字种植产业科技服务团| 杨坤 | 2023-11-22 15:07:55
做两个基因组比较分析时,该软件可以获得最长的两基因之间的匹配与不匹配区域,从而可以用于鉴定基因组特异的长序列片段
贪心算法获得最长比较序列

该成果可以用于比较分析不同农作物品种之间的基因组序列。通过鉴定基因组特异的长序列片段,可以深入了解不同品种之间的遗传差异和相似性,进而发掘优良性状和抗病抗虫等重要基因。这将有助于培育更加优质、高产、抗逆的农作物品种,为农业生产提供更加可靠的保障。

“科创中国”蔬菜数字种植产业科技服务团是由中国园艺学会牵头,中国农业科学院蔬菜花卉研究所、北京市农林科学院蔬菜研究所、中国农业大学园艺学院等单位组成的以数字技术改造传统农业种植为目标的产业科技服务团。服务团团长为中国农业科学院蔬菜花卉研究所生物技术研究室主任程锋研究员,成员包括分子技术、育种、栽培、植保、检测、管理等专业环节的20多位专家组成。2021年服务团首次成立,先后为山东寿光、兴内蒙安盟、重庆铜梁等地从事技术对接服务活动,2023年拟重点开展蔬菜数字选种、种苗、种植、植保、加工、质检数字化服务平台建设,为产业升级服务。

采用了类似于动态规划的贪心策略,逐步确定匹配和不匹配的区域,并尽量选择最长的序列进行匹配。这种算法可以在一定程度上减少计算量和时间复杂度,提高比较分析的效率。该成果可以帮助农民更好地选择和利用农作物品种,提高农作物的产量和质量。这将直接增加农民的经济收入,提高农业生产的效益和竞争力。同时,优质、高产、抗逆的农作物品种还可以满足人们日益增长的食品需求,为社会的稳定和可持续发展做出贡献。

可以进行技术转让或许可,具体费用可在双方协商后确定