本发明适用于生物检测技术领域,提供了病原微生物的检测方法及装置,包括:将测试宏基因组作为查询序列输入到预设的病原微生物数据库中;在所述预设的病原微生物数据库中对所述测试宏基因组进行BLAST运算,得到所述预设的病原微生物数据库中每种病原微生物的运算结果,所述运算结果包括所述病原微生物与其在所述测试宏基因组中所匹配到的微生物的相似性和相似的长度,以及包括所述病原微生物在所述测试宏基因组中所匹配到的微生物的个数;根据所述运算结果获取每种病原微生物的平均匹配值;将所述平均匹配值和所述匹配到的微生物的个数最高的病原微生物确定为所述测试宏基因组的检测结果。本发明的检测过程无需序列拼接,简单、高效。
一种病原微生物的检测方法,其特征在于,包括:创建预设的病原微生物数据库,所述预设的病原微生物数据库中收集的病原微生物包括真菌18S rDNA序列、细菌16S rDNA序列和病毒基因组;将测试宏基因组作为查询序列输入到所述预设的病原微生物数据库中;在所述预设的病原微生物数据库中对所述测试宏基因组进行BLAST运算,得到所述预设的病原微生物数据库中每种病原微生物的运算结果,所述运算结果包括所述病原微生物与其在所述测试宏基因组中所匹配到的微生物的相似性和相似的长度,以及包括所述病原微生物在所述测试宏基因组中所匹配到的微生物的个数、查询序列的ID、搜索数据集的ID、不匹配的碱基数、空缺的碱基、查询序列的起始位置、查询序列的终止位置、搜索数据集的起始位置、搜索数据集的终止位置;根据所述运算结果获取每种病原微生物的平均匹配值
病原微生物是指对人或动物具有致病性的微生物,包括病毒、细菌、衣原体、支原 体、螺旋体、真菌、放线菌等,这些病原微生物可引起感染、过敏、腹泻、肿瘤等疾病,甚至引 发死亡,因此,对病原微生物的检测必须做到快速、准确。传统的对病原微生物的检测方法 包括;直接涂片镜检、分离培养、生化反应、血清学反应、核酸分子杂交、基因芯片、多聚酶链 反应等,上述检测方法操作繁琐,检测周期长,而且对操作人员技术水平的要求比较高。此 夕卜,传统检测方法通常是对样品进行微生物的培养,通过判断培养出来的微生物的特征来 判断感染源,但由于技术限制,能够培养出的微生物不到所有微生物种类的1%,有很大的 局限性。
中国科学院深圳先进技术研究院提升了粤港地区及我国先进制造业和现代服务业的自主创新能力,推动我国自主知识产权新工业的建立,成为国际一流的工业研究院。 深圳先进院目前已初步构建了以科研为主的集科研、教育、产业、资本为一体的微型协同创新生态系统,由九个研究平台,国科大深圳先进技术学院,多个特色产业育成基地、多支产业发展基金、多个具有独立法人资质的新型专业科研机构等组成。开展先进技术研究,促进科技发展。信息、电子、通讯技术研究新材料、新能源技术研究高性能计算、自动化、精密机械研究生物医学与医疗仪器研究相关学历教育、博士后培养与学术交流。
本发明实施例提供了一种无线扩展器与接入点间的通信质量检测方法 及装置,以解决现有技术中均无法简单、高效地完成对病原微生物的检测的问题。在本发明实施例中,通过BLAST运算,得到预设的病原微生物数据库中每种病原微 生物与其在测试宏基因组中所匹配到的微生物的平均匹配值及个数,由于病原微生物在测 试宏基因组中为优势种群,因此,将平均匹配值及匹配个数最高的病原微生物确定为测试 宏基因组的检测结果,检测过程无需序列拼接,简单、高效。
技术合作
以上所述实施例仅用以说明本发明的技术方案,而非对其限制;尽管参照前述实 施例对本发明进行了详细的说明,本领域的普通技术人员应当理解:其依然可以对前述各 实施例所记载的技术方案进行修改,或者对其中部分技术特征进行等同替换;而这些修改 或者替换,并不使相应技术方案的本质脱离本发明实施例各实施例技术方案的精祌和范 围。
[0063]以上所述仅为本发明的较佳实施例而已,并不用以限制本发明,凡在本发明的精 神和原则之内所作的任何修改、等同替换和改进等,均应包含在本发明的保护范围之内。