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一种肿瘤单细胞转录组数据处理方法与软件

成果类型:: 发明专利

发布时间: 2022-11-17 19:03:30

科技成果产业化落地方案
方案提交机构:成果发布人| 欧阳文慧 | 2022-11-17 19:03:30

本项目围绕肿瘤单细胞转录组数据成果的技术核心点包括:1) 针对肿瘤单细胞实验过程中应激反应大、坏死细胞多的问题,提出了全面、精细的数据质量控制方案;2) 涵盖了常规的单细胞数据分析流程(数据标准化、降维、聚类、差异表达分析);3) 创新了肿瘤微环境细胞类型辨识和细胞恶性估计等方面的研究方法;4) 从重要表型(细胞周期、干性)、基因集(已知的和潜在的)两方面深度解析了肿瘤内部的异质性;5) 提出了考虑肿瘤间异质性的批次效应校正方法;6) 构建了自动化、智能化分析的软件平台,能够自动生成全面、直观的分析报告。

1) 自动化、集成式的肿瘤单细胞转录组数据分析软件scCancer;2) 针对软件使用和分析结果解读的服务;3) 针对更个性化数据分析需求的咨询与服务。

近年来快速发展的单细胞测序技术,为从单个细胞分辨率解析肿瘤的异质性和微环境特征、探索更为有效的肿瘤治疗方案提供了机遇,而与此同时,也对肿瘤单细胞数据的信息学分析提出了极大的需求,市场中亟需自动化、智能化、全面、高效的数据分析平台,来加快数据挖掘的速度,降低数据分析的门槛,提高从数据到信息的转化效率。 本项目研发的肿瘤单细胞转录组数据分析平台,能够进行快速、全面、智能、高效的数据分析,目前已得到很多科研人员的关注与认可,未来可在生物技术企业中进行充分推广与应用。

本项目科研团队负责人为古槿,清华大学自动化系副教授,博士生导师,现任中国自动化学会智能健康与生物信息专业委员会秘书长、中国人工智能学会生物信息学与人工智能专业委员会常务委员。主持国家自然科学基金优秀青年科学基金、重点项目、国家重点研发计划课题等国家级科研项目。科研团队针对恶性肿瘤等重大疾病诊疗的关键科学难题,立足前沿智能信息与生物技术,旨在解读生命遗传密码与复杂系统规律,实现疾病诊疗的可预测、精准化与个体化,已在肿瘤组学大数据智能信息处理、肿瘤分子分型与耐药机制发现等方面取得了若干成果,在Nature Cell Biology、Science Advances等杂志上发表论文40余篇。

本项目相关的学术成果已获得国内外研究人员的大量关注与引用,在多项科研成果中发挥了重要作用,并得到国内业界企业的积极关注与评价。 未来团队将计划基于授权软件商业化使用、为企业提供生物信息学数据分析的咨询服务、协助企业开展生物信息学培训等模式进行收费,实现商业化落地,产生经济效益。 癌症是目前严重威胁人类生命健康的疾病之一,基于单细胞测序技术研究肿瘤的微环境和异质性,对于理解肿瘤的机制、优化肿瘤的用药方案具有重要意义。

接受转化方式:技术咨询、创业融资。 团队要求:合作方和团队需要对肿瘤单细胞测序方面有较多的实践经验,能为本项目的应用与落地提供条件; 资金需求:合作方可为团队提供资金支持项目的维护与更新。