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香蕉枯萎病是一种毁灭性的的病害，病原菌为尖孢镰刀菌古巴专化型。香蕉枯萎病已经造成相当大的危害。上个世纪，病原菌1号（Foc1）生理小种破环了中美洲数千个香蕉园，现在世界范围内对香蕉产业的发展造成毁灭性的威胁为热带4号（Foc TR4）生理小种，已经导致我国台湾地区香蕉种植面积锐减为原来的十分之一。大陆地区种植的香（大）蕉中，90%以上为易感Foc TR4的香牙蕉品种， 2003年发病面积已经达到2万公顷，并有迅速蔓延的趋势。迄今还没有有效的防治香蕉枯萎病的方法。抗病育种速度远跟不上病原菌的进化速度，防治措施如改良土壤、化学防治等也没有取得突破性进展。人们逐渐认识到发展有效的防治措施及培育抗病品种需要更好地理解病原菌的生物多样性和进化规律、致病机理。对亚、非、中美洲、大洋洲的51个国家，4 Races、24VCGs的85个菌株进行基因组测序和重测序，测序覆盖度均在50倍以上，对数据进行组装和注释，利用比较基因组学技术和营养亲和性群技术，研究了全球范围内病原菌的进化规律，得到如下结果： 1. Foc TR4的进化非常保守，3个VCGs（VCG01213