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猪遗传育种的核心工作之一是利用可用的信息对潜在的重用个体进行准确地遗传评定，并依据遗传评定结果进行选种选配，进而使优良基因在群体中得以表达，提高群体的生产水平。长期以来，以传统BLUP为主的遗传评定方法为猪群体遗传改良做出了巨大贡献。目前，随着基因组学的不断进步，畜禽测序及SNP芯片技术已十分成熟。人们可利用这些精确的遗传信息准确预测个体的遗传效应，该方法称为基因组选择。该技术自2001年提出以来，已经在畜禽、作物、水产、林业以及人类复杂疾病方面得到广泛的关注，并在全球奶牛育种中得到全面应用。如何利用全基因组高密度遗传标记进行基因组选择育种已成为猪遗传育种领域的应用热点。在相关项目支持下，本项目构建了猪基因组选择参考群和基因组遗传评估软硬件平台、制定了猪基因组选择遗传评定规程等。研究结果表明：在猪群体中应用基因组选择技术可提高选择准确性25%，对于低遗传力、非常规性状，有更好地应用效果。同时该项目获得授权软件著作权3项，授权专利2项，培养博士生1名，硕士5名，发表学术论文11篇，建立推广示范基地1个。该成果可在规模化猪育种群体中按照育种操作规范直接实施，实施后可有效加速猪遗传进展，提高育种经济效益，是未来猪育种的标准技术。