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本发明提供了基于多标签特征选择的基因分类方法、系统及设备，方法包括：获取基因表达数据集，利用基于缺失基因数据的多标签特征选择模型对基因表达数据集进行特征选择，得到基因表达数据集的特征子集；利用基因表达数据集的特征子集，对基因分类模型进行训练，得到训练好的基因分类模型；基于待分类基因数据的特征子集，利用训练好的基因分类模型对待分类基因进行分类，得到待分类基因数据的标签。

本发明采用基于多标签特征选择的基因分类方法，基于缺失数据完成多标签基因数据的特征选择，考虑基因标签和特征之间的所有依赖关系，并基于特征选择后的特征子集来完成基因分类，从而从根源上解决了现有的多标签基因分类准确性低的问题。

重庆大学（ChongqingUniversity，CQU），简称“重大”，是中华人民共和国教育部直属，由教育部、重庆市、国家国防科技工业局共建的全国重点大学，位列国家“双一流”、“211工程”、“985工程”，入选“珠峰计划”、“强基计划”、“高等学校创新能力提升计划”、“高等学校学科创新引智计划”、“卓越工程师教育培养计划”、“卓越法律人才教育培养计划”、国家建设高水平大学公派研究生项目、中国政府奖学金来华留学生接收院校、教育部来华留学示范基地，为卓越大学联盟、中波大学联盟、一带一路高校联盟、“长江—伏尔加河”高校联盟、CDIO工程教育联盟、中国高等戏剧教育联盟成员单位、“国优计划”首批试点高校。