本发明提供一种凝胶电泳耦合液相色谱‑质谱联用(LC‑MS/MS)的DNA修饰检测方法,包括以下步骤:通过凝胶电泳法分离待测DNA样品,得到含目标DNA的凝胶条,其中,所述凝胶电泳法中使用的电泳缓冲液不含EDTA;通过凝胶内DNA酶解法将所述凝胶条中的所述目标DNA酶解为单个脱氧核苷/脱氧核苷酸,得到酶解产物;对所述酶解产物进行液相色谱‑质谱联用检测,得到DNA化学修饰(包括表观遗传修饰和DNA损伤加合物)结果。通过本发明的检测方法可精确定量凝胶分离的不同DNA组分中的化学修饰信息。
本发明使用凝胶电泳法对DNA样品进行分离,使得目标DNA在酶解前较好地得到了纯化,并且具有良好的分离产量,凝胶电泳操作也较为简便。并且,进一步地发现,在不含EDTA条件下进行凝胶电泳而得到的含目标DNA的凝胶条适合直接胶内酶解,得到脱氧核苷或脱氧核苷酸以作为LC‑MS/MS检测的样品,可获得较为准确的DNA化学修饰结果。
实验室现有研究组21个,其中固定人员102人,包括中国科学院院士1人,中国工程院院士1人,美国工程院院士1人,研究员44人(外籍3名),973项目首席科学家5人,国家杰出青年基金获得者11人,优秀青年基金获得者14人,千人计划获得者4人,中国科学院“百人计划”获得者11人。另有博士后和研究生约400余人。
评价单位:“科创中国”中科院生态环境研究中心废水无害化与资源化科技服务团 (中国科学院生态环境研究中心)
评价时间:2023-12-05
袁洪
巴音郭楞蒙古自治州科学技术协会
副高级研究员
综合评价
通过本发明的检测方法可精确定量凝胶分离的不同DNA组分中的化学修饰信息。
查看更多>