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鉴定甜瓜果肉厚度性状的分子标记、方法、引物对、试剂盒及其应用，属于分子标记辅助育种技术领域。为了获得与甜瓜果肉厚度性状紧密连锁的染色体区段及分子标记，进而更快捷地和更准确地在甜瓜苗期对甜瓜果肉厚度进行鉴定，本发明提供了一种与甜瓜果肉厚度性状紧密连锁的分子标记，该分子标记存在一处SNP位点的变化。通过引物对对甜瓜幼苗基因组DNA进行PCR扩增，再利用限制性内切酶MboI酶切PCR扩增产物，根据酶切产物是否具有689bp片段即可对甜瓜是否具有厚果肉性状进行区分。上述鉴定方法，操作简便，准确度高，为甜瓜果肉厚度性状的分子鉴定提供了行之有效的分子育种工具。

为了获得与甜瓜果肉厚度性状紧密连锁的染色体区段及分子标记，进而更快捷地和更准确地在甜瓜苗期对甜瓜果肉厚度进行鉴定，本发明提供了一种与甜瓜果肉厚度性状紧密连锁的CAPS8109分子标记，所述CAPS8109分子标记为核苷酸序列如SEQ ID ***所示的核苷酸片段和核苷酸序列如SEQ ID ***所示的核苷酸片段；所述SEQ ID ***与薄果肉性状紧密连锁，所述SEQ ID ***与厚果肉性状紧密连锁。在本发明中所述薄果肉性状的果肉厚度范围为***，所述厚果肉性状的果肉厚度范围为***。本发明还提供了引物对和限制性内切酶MboI在鉴定甜瓜果肉厚度中的应用，所述引物对包括核苷酸序列如SEQ ID ***所示的上游引物和核苷酸序列如SEQ ID ***所示的下游引物，所述应用为利用引物对扩增甜瓜基因组DNA获得扩增产物，再利用限制性内切酶MboI酶切扩增产物，根据酶切产物来鉴定甜瓜果肉厚度。

东北农业大学（Northeast Agricultural University，英文简称：NEAU），简称为“东北农大”，位于黑龙江省哈尔滨市香坊区长江路600号，由黑龙江省教育厅负责管辖， [46] 是国家“双一流”建设高校 [35] 、“双一流”农科联盟 [61] 、国家首批“211工程”建设高校，黑龙江省人民政府与中华人民共和国农业部共建高校，入选国家中西部高校基础能力建设工程、卓越农林人才教育培养计划项目试点、高等学校创新能力提升计划 [1] ，是全国首批博士、硕士学位授予单位，黑龙江省重点建设的省属特色高水平大学，“援疆学科建设计划”，首批高等学校科技成果转化和技术转移基地。