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一种线虫身体弯曲行为的识别和计数方法及相关设备

发布时间: 2023-10-07

来源: 科技服务团

基本信息

合作方式: 技术服务
成果类型: 发明专利
行业领域:
物理
成果介绍
本发明公开了一种线虫身体弯曲行为的识别和计数方法及相关设备,所述方法包括:获取线虫视频,对所述线虫视频进行分帧处理得到原始灰度图像,根据所述原始灰度图像得到线虫二值图像;根据线虫的所述原始灰度图像,基于卷积神经网络的数值坐标回归算法获得头部坐标和尾部坐标;根据所述线虫二值图像,基于曲率的特征点提取算法计算线虫中心线上的峰值点;计算峰值点到线虫的咽部和尾部之间连线的最大距离,根据每帧最大距离的变化计算线虫身体弯曲的数量。本发明基于卷积神经网络的数值坐标回归算法进行线虫头部和尾部的坐标识别,提高了准确率,通过提取特征点,实现了更加简单快速的计算线虫身体弯曲次数。
成果亮点
1.一种线虫身体弯曲行为的识别和计数方法,其特征在于,所述线虫身体弯曲行为的识别和计数方法包括: 获取线虫视频,对所述线虫视频进行分帧处理得到原始灰度图像,根据所述原始灰度图像得到线虫二值图像; 根据线虫的所述原始灰度图像,基于卷积神经网络的数值坐标回归算法获得头部坐标和尾部坐标; 根据所述线虫二值图像,基于曲率的特征点提取算法计算线虫中心线上的峰值点; 计算峰值点到线虫的咽部和尾部之间连线的最大距离,根据每帧最大距离的变化计算线虫身体弯曲的数量。 2.根据权利要求1所述的线虫身体弯曲行为的识别和计数方法,其特征在于,所述获取线虫视频,对所述线虫视频进行分帧处理得到原始灰度图像,根据所述原始灰度图像得到线虫二值图像,具体包括: 对获取的所述线虫视频进行分帧处理,得到所述原始灰度图像; 选取所述原始灰度图像进行裁剪,获取图像四个角点的灰度值的最大值,其中,至少有一个角点始终不属于线虫身体,确定所述原始灰度图像的背景层的像素值; 使用预设大小的滑动窗口扫描所述原始灰度图像,计算所述滑动窗口内像素在每个像素位置的平均值和标准差;
团队介绍
中国科学院深圳先进技术研究院提升了粤港地区及我国先进制造业和现代服务业的自主创新能力,推动我国自主知识产权新工业的建立,成为国际一流的工业研究院。 深圳先进院目前已初步构建了以科研为主的集科研、教育、产业、资本为一体的微型协同创新生态系统,由九个研究平台,国科大深圳先进技术学院,多个特色产业育成基地、多支产业发展基金、多个具有独立法人资质的新型专业科研机构等组成。开展先进技术研究,促进科技发展。信息、电子、通讯技术研究新材料、新能源技术研究高性能计算、自动化、精密机械研究生物医学与医疗仪器研究相关学历教育、博士后培养与学术交流。
成果资料
产业化落地方案
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