做两个基因组比较分析时,该软件可以获得最长的两基因之间的匹配与不匹配区域,从而可以用于鉴定基因组特异的长序列片段
植保研究室病害课题组长期从事针对蔬菜根结线虫、枯萎病、病毒病等重大蔬菜病害的发生规律、致病机理、抗病基因发掘利用、生物防治、蔬菜抗病性鉴定及绿色防控技术等方面研究工作。相继主持国家973、863、科技支撑计划、国家重点研发计划重点专项、国家自然科学基金(重点、面上、青年)、公益性行业(农业)科技专项等项目30多项。在蔬菜根结线虫等病原物的效应子功能研究,番茄、辣椒及黄瓜的热稳定性抗线虫基因克隆,淡紫紫孢菌白灰质菌素合成机理,蔬菜抗病品种鉴定筛选,以及木霉菌、芽孢杆菌等生防菌应用技术创新等方面取得了一系列成果。近年来,病害课题组获得国家科技进步二等奖3项(参加),获部级成果1项,获国家授权发明专利28项,著作权20项,制定国家及农业行业标准35项,农业部主推技术3项。在New Phytologist等期刊发表论文170余篇,其中SCI 100余篇。团队成果对于保障我国蔬菜产业的可持续发展及蔬菜安全生产做出了重要贡献。
评价单位:“科创中国”蔬菜数字种植产业科技服务团 (中国园艺学会)
评价时间:2023-11-25
杨坤
中国农业科学院蔬菜花卉研究所
课题组长、常务副主任/正高级农艺师
综合评价
这个成果的创新点在于使用了贪心算法来找出两个基因组中最长的匹配区域,这对于鉴定基因组特异的长序列片段非常有用。市场前景广阔,可以帮助科研人员和生物技术公司更快地分析基因组数据。产业化路径清晰,可以通过改进算法和优化性能来实现更高效的分析。投资风险较低,回报潜力较大。
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