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基于圆周统计的蛋白质折叠的表征方法及系统

发布时间: 2023-08-16

来源: 科技服务团

基本信息

合作方式： 技术服务
成果类型： 发明专利
行业领域：
生物与新医药技术
成果介绍
本发明涉及生物信息学技术领域，特别涉及一种基于圆周统计的蛋白质折叠的表征方法及系统。本发明的方法基于圆周统计对蛋白质折叠进行表征，高效、准确，即可以更快研究蛋白质的折叠，也可以更准确描述蛋白质动态变化，从而研究相关神经退行性疾病的机理。一种基于圆周统计的蛋白质折叠的表征方法，其特征在于，包括如下步骤：步骤1：建立第一圆周统计模型，用角度方差V(a)＝1-R(a)表征热动力学涨落，其中R2(a)＝2+2＜1；建立第二圆周统计模型，用角度协方差表征热动力学涨落；步骤2：用第一圆周统计模型或第二圆周统计模型对待研究蛋白质序列构型中两侧链之间的氢键、两主链之间的氢键及两侧链之间的二硫键进行热动力学涨落分析
成果亮点
分析主链上第m个氨基酸残基和第n个氨基酸残基之间的侧链相互作用能量的涨落，当涨落值大于预设链相互作用能量热涨落阈值时，对第m个氨基酸残基和第n个氨基酸残基进行标记；步骤4：将待研究蛋白质的侧链分为亲水侧链和疏水侧链，并分别对亲水侧链和疏水侧链进行标记，分别用第一圆周统计模型和第二圆周统计模型分析不同亲水侧链之间的二面角相互作用热涨落、亲水侧链与疏水侧链之间的二面角相互作用热涨落、不同疏水侧链之间的二面角相互作用热涨落；当涨落值大于预设二面角相互作用热涨落阈值时，采用第一圆周统计模型表征；当涨落值小于预设二面角相互作用热涨落阈值时，采用第二圆周统计模型表征。
团队介绍
中国科学院深圳先进技术研究院提升了粤港地区及我国先进制造业和现代服务业的自主创新能力，推动我国自主知识产权新工业的建立，成为国际一流的工业研究院。 深圳先进院目前已初步构建了以科研为主的集科研、教育、产业、资本为一体的微型协同创新生态系统，由九个研究平台，国科大深圳先进技术学院，多个特色产业育成基地、多支产业发展基金、多个具有独立法人资质的新型专业科研机构等组成。开展先进技术研究，促进科技发展。信息、电子、通讯技术研究新材料、新能源技术研究高性能计算、自动化、精密机械研究生物医学与医疗仪器研究相关学历教育、博士后培养与学术交流。
成果资料
产业化落地方案
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