科创中国

生物与新医药技术

本发明适用于生物检测技术领域，提供了病原微生物的检测方法及装置，包括：将测试宏基因组作为查询序列输入到预设的病原微生物数据库中；在所述预设的病原微生物数据库中对所述测试宏基因组进行BLAST运算，得到所述预设的病原微生物数据库中每种病原微生物的运算结果，所述运算结果包括所述病原微生物与其在所述测试宏基因组中所匹配到的微生物的相似性和相似的长度，以及包括所述病原微生物在所述测试宏基因组中所匹配到的微生物的个数；根据所述运算结果获取每种病原微生物的平均匹配值；将所述平均匹配值和所述匹配到的微生物的个数最高的病原微生物确定为所述测试宏基因组的检测结果。本发明的检测过程无需序列拼接，简单、高效。

一种病原微生物的检测方法，其特征在于，包括：创建预设的病原微生物数据库，所述预设的病原微生物数据库中收集的病原微生物包括真菌18S rDNA序列、细菌16S rDNA序列和病毒基因组；将测试宏基因组作为查询序列输入到所述预设的病原微生物数据库中；在所述预设的病原微生物数据库中对所述测试宏基因组进行BLAST运算，得到所述预设的病原微生物数据库中每种病原微生物的运算结果，所述运算结果包括所述病原微生物与其在所述测试宏基因组中所匹配到的微生物的相似性和相似的长度，以及包括所述病原微生物在所述测试宏基因组中所匹配到的微生物的个数、查询序列的ID、搜索数据集的ID、不匹配的碱基数、空缺的碱基、查询序列的起始位置、查询序列的终止位置、搜索数据集的起始位置、搜索数据集的终止位置；根据所述运算结果获取每种病原微生物的平均匹配值

中国科学院深圳先进技术研究院提升了粤港地区及我国先进制造业和现代服务业的自主创新能力，推动我国自主知识产权新工业的建立，成为国际一流的工业研究院。 深圳先进院目前已初步构建了以科研为主的集科研、教育、产业、资本为一体的微型协同创新生态系统，由九个研究平台，国科大深圳先进技术学院，多个特色产业育成基地、多支产业发展基金、多个具有独立法人资质的新型专业科研机构等组成。开展先进技术研究，促进科技发展。信息、电子、通讯技术研究新材料、新能源技术研究高性能计算、自动化、精密机械研究生物医学与医疗仪器研究相关学历教育、博士后培养与学术交流。

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