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生物与新医药技术

本发明涉及一种多聚谷氨酰胺致病机理的分析方法，包括以下步骤，S1、选择蛋白质模型：二维整点HP模型；S2、确定能量函数；S3、搜索自由能最小的蛋白质二维构型：采用对等模式的MPI并行算法搜索能量最小的蛋白质所对应的二维结构的步骤为，本发明提供的多聚谷氨酰胺致病机理的分析方法与现有技术相比，采用在多聚谷氨酰胺蛋白质构型群体中，构型个体的温度由该个体次序所决定，通过将较高的温度分配给较差的个体，使之更有可能向较好的个体变动；同时，使用降温因子加速收敛速度，采用并行方式可加快收敛速度。

一种多聚谷氨酰胺致病机理的分析方法，其特征在于，包括以下步骤，S1、选择蛋白质模型：二维整点HP模型；S2、确定能量函数：E=Σi其中，σi表示肽链上第i个氨基酸残基，ri表示第i个氨基酸位置；A为一正整数；m、n为网格节点数；S3、搜索自由能最小的蛋白质二维构型：采用对等模式的MPI并行算法搜索能量最小的蛋白质所对应的二维结构的步骤为，S31、确定α,β以及Tref的值，每个进程随机产生个体i，其中i＝0,…,N-1，，并计算个体的能量函数Ei，初始化记录器，其中，Tref为初始参考温度，α为分配因子，β为降温因子；S32、建立通信，确定个体的ri以及个体的温度Ti；S33、利用构型变动集进行随机变动，构建新的构型，并计算新的能量函数Enew，对t累加；S34、重复步骤S33，当迭代步数超过阈值，停止计算；否则，Tref＝βTref，β为降温因子，返回步骤S32再次迭代。

国科学院深圳先进技术研究院提升了粤港地区及我国先进制造业和现代服务业的自主创新能力，推动我国自主知识产权新工业的建立，成为国际一流的工业研究院。 深圳先进院目前已初步构建了以科研为主的集科研、教育、产业、资本为一体的微型协同创新生态系统，由九个研究平台，国科大深圳先进技术学院，多个特色产业育成基地、多支产业发展基金、多个具有独立法人资质的新型专业科研机构等组成。开展先进技术研究，促进科技发展。信息、电子、通讯技术研究新材料、新能源技术研究高性能计算、自动化、精密机械研究生物医学与医疗仪器研究相关学历教育、博士后培养与学术交流。

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