科创中国
基于ATAC测序数据筛选子宫内膜癌关键基因的方法及应用
发布时间: 2023-05-18
来源: 科技服务团
基本信息
合作方式：
技术转让
成果类型：
发明专利
行业领域：
生物与新医药技术
成果介绍
目前，肿瘤关键基因筛选方法主要包括以下三种：(1)利用突变小鼠，进行正向基因筛查并确定与人类癌症高度相关的候选驱动基因；(2)基于蛋白质序列、功能注释和相互作用网络等方面通过研究基因在肿瘤中的特征以分选出候选肿瘤基因；(3)基于公共数据库提取差异表达基因，结合蛋白互作网络(PPI)进行关键基因的筛选。
但上述肿瘤关键基因筛选方法都具有明显的缺陷和不足。首先，由于物种间的差异显著，导致在利用突变小鼠进行关键基因筛查时得到的候选驱动基因在人体中的作用较小鼠具有显著差异，不够准确，同时利用突变小鼠进行关键基因筛查的方法主要针对的是反复突变的“显著突变基因”，那些罕见突变基因无法被获取到。
成果亮点
由于蛋白质序列只能反映编码区的基因组成，因此，基于蛋白质序列、功能注释和相互作用网络等方面通过研究基因在肿瘤中的特征以分选出候选肿瘤基因的方法对基因的功能注释主要集中在基因的编码区，而占比约97％的基因非编码区同样对肿瘤发生和发展具有重要作用，而这一方法无法对非编码区进行功能注释，同时，该方法对具有已知功能注释的基因进行研究筛选时存在偏差。
随着基因数据库的逐渐丰富，利用公共数据库提取差异表达基因，结合蛋白互作网络进行关键基因筛选的方法逐渐成为肿瘤关键基因筛选的重要手段，但由于数据来源受实验条件、技术以及对照组选择标准的制约，一组或者几组筛选数据并不能代表广泛的病例。
团队介绍
哈尔滨医科大学坐落在北国冰城哈尔滨，是一所历史文化底蕴深厚的医学高等学府，由我国现代医学先驱伍连德博士于1926年创办的滨江医学专门学校（1938年更名为哈尔滨医科大学）和前身为中国共产党于1931年在江西瑞金创建的中国工农红军军医学校原兴山（现鹤岗市）中国医科大学第一、二分校组建而成。学校历经97年的发展建设，传承伍连德博士“赤诚爱国、自强创业”的精神，发扬中国工农红军军医学校“政治坚定、技术优良”的光荣传统，秉承“木直中绳、博学载医”的校训，综合实力不断增强，具有相当的发展规模和鲜明的办学特色。学校是部委省共建大学、黑龙江省国内一流大学建设高校、中俄医科大学联盟中方牵头单位、国家理科基础科学研究与教学人才培养基地、教育部首批试办七年制高等医学教育院校、教育部高水平公共卫生学院建设高校。
成果资料
产业化落地方案
成果综合评价报告
评价单位：“科创中国”黑龙江科技服务团 (黑龙江省科学技术协会) 评价时间：2023-11-10
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