科创中国
一种鉴定肿瘤细胞的染色体外环状DNA组成基因的方法
发布时间: 2023-05-09
来源: 科技服务团
基本信息
合作方式：
技术转让
成果类型：
发明专利
行业领域：
生物与新医药技术
成果介绍
染色体外环状DNA，最早在1965年，由HOTTA Y通过对肿瘤细胞核型分析发现的，但是因为当时分子技术水平的局限，未能得到广泛的关注，后来由于FISH(Fluorescence insitu hybridization，荧光原位杂交技术)技术的兴起，人们进一步了解了染色体外环状DNA的分子结构。但是FISH技术存在如下缺点：1)FISH实验手段非常繁琐，造价高昂；2)其分辨率很低，只能检测到1M左右的区域；3)对实验样本的要求很高，如必须得到中期分裂的细胞，这对于临床上组织样本的检测是无法实现的。因此，由于分辨率的限制，目前的技术只能获得较大片段的染色体外环状DNA上的基因信息，急需更高分辨率，准确性更高的手段来探索染色体外环状DNA上基因，这对于肿瘤的诊断及治疗有着重要意义。
成果亮点
在2019年，Deshpande V发明了一款软件，AmpliconArchitect，其利用二代测序数据对染色体外DNA进行预测。但是该软件在使用时需要提供指定的bed(靶向测序中一个能够指示目标基因位置的文件类型)区域，而该软件目前没有任何可以预测bed区域的工具，另外，因为肿瘤细胞的基因扩增是异常的，而该软件并未就肿瘤细胞的拷贝数进行有效校正。
团队介绍
哈尔滨医科大学坐落在北国冰城哈尔滨，是一所历史文化底蕴深厚的医学高等学府，由我国现代医学先驱伍连德博士于1926年创办的滨江医学专门学校（1938年更名为哈尔滨医科大学）和前身为中国共产党于1931年在江西瑞金创建的中国工农红军军医学校原兴山（现鹤岗市）中国医科大学第一、二分校组建而成。学校历经97年的发展建设，传承伍连德博士“赤诚爱国、自强创业”的精神，发扬中国工农红军军医学校“政治坚定、技术优良”的光荣传统，秉承“木直中绳、博学载医”的校训，综合实力不断增强，具有相当的发展规模和鲜明的办学特色。学校是部委省共建大学、黑龙江省国内一流大学建设高校、中俄医科大学联盟中方牵头单位、国家理科基础科学研究与教学人才培养基地、教育部首批试办七年制高等医学教育院校、教育部高水平公共卫生学院建设高校。
成果资料
产业化落地方案
成果综合评价报告
评价单位：“科创中国”黑龙江科技服务团 (黑龙江省科学技术协会) 评价时间：2023-11-10
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