基于属性编辑流的分子生成方法,本发明涉及分子生成方法。本发明的目的是为了解决现有分子生成方法中CRNN模型没能给出与待合成分子结构相似的分子,以及Mol‑CycleGAN模型对属性的优化欠缺灵活性,且属性的选择需要是0或1真假逻辑取值的,即有或无,不能包含第三种取值,更不能是连续的数值
本发明提出了一种基于流模型的可进行多属性编辑的分子生成模型AEMF,该模型可根据给出的原分子和需要的目标属性,对模型隐空间中对原分子对应的隐向量进行属性语义上的向量操作,将经过属性编辑后的隐向量在流模型中解码,生成诸多与原分子结构相似且十分接近目标属性的新颖分子。
本发明针对以往分子生成工作中的问题提出了一个属性编辑流分子生成模型AEMF,该模型可对输入的分子进行属性编辑,通过AttrEditor模块可在隐空间中对分子的编码进行语义上的向量操作,生成诸多与原分子相似的分子,并且生成的这些分子的属性与给出的目标属性十分接近。这更加贴近新化合物合成的过程,对已有的化合物分子进行针对性质的改造,由于改造后生成的全新分子与原分子的相似性较高,所以更易于通过化学反应等方式来人工合成。
由于本发明模型对分子的性质改造是在流模型的隐空间中进行的,这要求隐空间必须是连续的,这样才可以保证进行了属性编辑向量位移后得到的隐向量是正确的
黑龙江大学(Heilongjiang University),位于黑龙江省哈尔滨市,是黑龙江省人民政府和中华人民共和国教育部、国家国防科技工业局共建的省属综合性大学,黑龙江省“双一流”建设国内一流大学A类高校,入选国家卓越法律人才教育培养计划、中西部高校基础能力建设工程、特色重点学科项目、国家建设高水平大学公派研究生项目、中国政府奖学金来华留学生接收院校、全国深化创新创业教育改革示范高校、教育部来华留学示范基地,是世界翻译教育联盟、中俄新闻教育高校联盟、中俄综合性大学联盟、上海合作组织大学、“一带一路”智库合作联盟成员单位
评价单位:“科创中国”黑龙江科技服务团 (黑龙江省科学技术协会)
评价时间:2022-12-08
综合评价
基于属性编辑流的分子生成方法,本发明涉及分子生成方法。本发明的目的是为了解决现有分子生成方法中CRNN模型没能给出与待合成分子结构相似的分子,以及Mol‑CycleGAN模型对属性的优化欠缺灵活性,且属性的选择需要是0或1真假逻辑取值的,即有或无,不能包含第三种取值,更不能是连续的数值,导致无法生成与原分子结构相似且十分接近目标属性的新分子的问题。过程为:一、建立分子对数据集;二、建立属性编辑流分子生成模型AEMF;三、训练属性编辑流分子生成模型AEMF;四、基于训练好的属性编辑流分子生成模型AEMF生成目标分子。本发明用于分子生成领域。
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