科创中国

生物与新医药技术,现代农业技术

本课题组开发了一种极低成本、高效、灵活、高通量的DNA测序文库制备和基因分型方法——Hyper-seq技术。该技术可应用在不同物种的建库和测序实验中，成功解决了基因组DNA片段非酶切直接测序问题，从而降低对DNA样品质量要求；进而采用大规模Barcode混合测序，大大降低了测序成本。该技术具有高通量、基因区偏置性、快速和超低成本特征。单个样本分析成本在50-150元人民币（根据基因组大小设计测序覆盖度），较世界同类简化测序技术（GBS、RAD等）和分子育种芯片技术成本降低50%以上，建库时间更短约3-5小时，利用二代高通量测序仪器完成96孔或者384孔混合样本测序。同时以及开发Hyper-seq软件流程（***），搭建基于Hyper-seq的高通量规模化基因型分析平台。在水稻、小麦、玉米、木薯等50个作物中开始前期应用研究。 目前已利用相关技术在Cell Press合作期刊The Innovation上发表了。

1.成本低廉（单个样本成本约20美金）。随着高通量测序技术的飞速发展，目前简化测序技术市场上层出不穷，但大群体样本测序费用一直居高不高，Hyper-seq技术将测序费用压缩至极致，远远低于目前世界上同类简化测序技术（GBS、RAD等）和分子育种芯片技术，完成1000份水稻样品的测序仅需要一天，一个样品的成本仅需要10美元。 2 建库时间短，效率高，过程简单便于操作。实验没有限制性内切酶的限制，仅依靠添加特定引物进行PCR扩增，后续无需再进行纯化步骤，无需挑出barcode接头，即可完成测序。整个建库时间缩短为3-5个小时，建库样本单次可高达384个样本，与同类技术相比，化繁为简，极大程度的节约了时间成本。 3 目前没有单项技术能够适应不同类型需求和不同特异性物种测序。Hyper-seq技术不只是针对简单植物进行测序，还开发了针对大型复杂基因组简化的引物，比如小麦、土豆、玉米等，以针对物种特点制定简化程度，而这一过程无需在实验操作中额外增加环节。 4 对样品DNA质量要求不高。

海南大学热带作物学院源于1958年创建的华南热带作物学院（后更名为华南热带农业大学）栽培系。后经历华南热带农业大学农学院、海南大学农学院，2007年原华南热带农业大学与原海南大学合并成立新海南大学，设立农学院。2019年，学校正式设立海南大学热带作物学院。学院是首批国家卓越农林人才培养计划单位和首批国家农科教合作人才培养基地。2017年9月，学院作物学学科入选国家首轮世界一流学科建设学科，2022年2月入选国家第二轮世界一流学科建设学科，“植物与动物科学”及“农业科学”进入ESI 全球前1%。 海南大学热带作物学院现有教职工180多人，包括长江学者2人，国家杰出青年基金获得者2人，“万人计划”科技创新领军人才4人，“万人计划”青年拔尖人才1人，中科院“百人计划”获得者2人，中国科协“青托人才”3人，国家木薯产业技术体系岗位科学家2人，全国先进工作者1人、全国优秀科技工作者1人、教育部“新世纪优秀人才支持计划”3人，海南省创新创业人才1人、 海南省“百人专项”2人、 海南省“千人专项”1人、海南省三八红旗手2人、515人才工程第二层次以上人选6人、宝钢教育基金优秀教师3人

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