本发明公开了一种基于流式细胞技术高通量筛选产乙醇真菌的试剂盒及其应用,该试剂盒包括盒体与试剂,还包括细胞培养板、离心管和铜筛,所述的试剂为:试剂A:柠檬酸:***;柠檬酸钠:***;1000mL;试剂B:碘化丙啶(PI):***;2,7二氢二氯荧光黄双乙酸钠:***;试剂C:葡萄糖:2g,50mL;试剂D:葡萄糖:12g,50mL;试剂E:酵母粉:***;胰蛋白胨:***;磷酸氢二铵:***;硫酸镁:***,***,50mL;试剂F:酵母粉:***;胰蛋白胨:***;磷酸氢二铵:***;硫酸镁:***,***,50mL。