利用 PCR-SSCP 快速检测绵羊 NELF 基因单核苷酸多态性的方法及 其应用
发布时间: 2022-05-13
来源: 试点城市(园区)
基本信息
技术领域
本发明属于分子遗传学领域,涉及绵羊单核苷酸多态性(SNP)分子标记的筛选
与检测,特别涉及利用 PCR-SSCP 方法快速检测 NELF 基因组第 454 位点单核苷酸
多态性。具体来说,就是对 PCR 扩增获得的产物变性之后进行聚丙烯酰胺凝胶电
泳,然后根据电泳结果确定其单核苷酸多态性。
背景技术
近 20 年来,尤其是近 10 年来,分子遗传学和分子生物技术有了突飞猛进的
发展,其中,分子遗传标记是目前在家畜育种中研究得最多的内容,也是近期内
最可能在家畜育种中得到广泛应用的研究项目。遗传标记是指那些可以准确鉴别
的、能反映个体特异性的遗传特征。分子遗传标记则是指以个体遗传物质即核苷
酸序列变异为基础的 DNA 分子标记,是 DNA 水平遗传多态性的直接反映。利用
分子标记辅助选择育种,是现代动物分子育种的一项主要研究内容,其直接在
DNA 水平上对性状的基因型进行选择,因此其选种的准确性大大提高,克服了传
统动物育种方法的缺陷。
单核苷酸多态性(SNP)是一种重要的分子遗传标记,它是由美国学者 Lander
于 1996 年提出的第三代 DNA 遗传标记,是基因组中单个核苷酸变异引起的 DNA
序列多态性,包括碱基的转换、插入及缺失等形式。PCR-SSCP 技术的基本原理是
PCR 扩增后的 DNA 片段经变性成单链 DNA,单链 DNA 在中性聚丙烯酰胺凝胶中
电泳时形成不同的立体构象,其构象直接影响泳动速率,相同长度的 DNA 单链
其核苷酸顺序仅有单个碱基的差别,就可以产生立体构象的不同,造成泳动速率
的不同,产生不同的泳动带。因此,可以通过 PCR-SSCP 技术检测基因组是否存
在 SNP 位点,并且准确的鉴别 SNP 位点的基因型。现在已经公认单链构象多态性
(SSCP)可作为遗传标记应用于育种中。该方法不仅具有 DNA 测序法的准确性,又
克服了费用昂贵、繁琐操作、假阳性的缺点,而且检测序列位点无特殊要求。
鼻胚胎促黄体激素释放激素因子(Nasal embryonic LHRH factor,NELF)编码基
因与动物的生殖有密切关系。Samuel *** 等通过创建纯合 NELF 敲除(KO)
小鼠模型,证明雌性小鼠 NELF 基因敲除将推迟阴道口开放,并没有延迟第一次
发情的时间,减少了子宫重量并且减少了 GnRH 的神经元数目。与此相反,雄性
小鼠的青春期表现正常。NELF 敲除导致雌雄小鼠都表现为生育能力受损,平均窝
产仔数降低。此外,越来越多的报道表明,NELF 在小鼠的生殖方面有重要作用。
绵羊的 NELF 基因定位在第 20 号染色体上,全长 5928bp,编码区全长 1112bp。
目前,国内外对 NELF 基因多态性的研究主要集中于小鼠等模式动物,而对
于家畜 NELF 基因单核苷酸多态性的研究尚未见报道。
发明内容
本发明的目的在于提供一种利用 PCR-SSCP 快速检测绵羊 NELF 基因单核苷酸
多态性的方法及其应用,从而为绵羊的分子标记辅助选择育种提供基础资料,加
快中国绵羊的种质资源改良工作。