本发明提供一种时域流数据的增量式频域变换系统及变换方法,所述变换系统包括输入模块、流数据处理框架和输出模块;输入模块,用于向所述流数据处理框架输入时间序列流数据,时间序列流数据包括多个时间点的时域流数据;流数据处理框架,用于在其中对每一个时间点的时域流数据进行快速傅里叶变换,形成每一个时间点的时域流数据对应的频域流数据;输出模块,用于将流数据处理框架中的所述频域流数据输出。本发明针对时间序列流数据,对每一个单点时域流数据进行快速傅里叶变换,相比传统的对时间序列数据进行批量处理,具有更高的实时性。