本发明提供一种显微镜下急性分离神经细胞捕捉系统及方法,涉及膜片钳封接细胞捕捉领域,特别适用于膜片钳实验中在显微镜下快速捕捉符合封接条件的急性分离的神经细胞。该系统包括显微镜电子目镜、计算机、单片机、驱动器、步进电机和膜片钳系统显微镜载物台。本发明提供的系统能够精确捕捉符合封接条件的神经细胞,将不符合封接条件的细胞予以剔除,并自动移动膜片钳系统显微镜载物台,使细胞移至显微镜视野中央,可大大节省膜片钳实验中寻找符合封接条件细胞的时间和精力,并使长时间在显微镜下工作实验人员避免出现头晕、恶心等不良反应,且加装在膜片钳系统中不影响其它任何操作,因此易于推广。