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       本发明公开了一种与小麦千粒重和株高相关的分子标记***及其应用。两个单核苷酸多态性位点，分别对应于序列表序列1自5′末端第31位和序列表序列2自5′末端第264位，在小麦多态性群体中被发现。在自然群体中，这两个SNP主要存在两种单体型：单体型甲（C、A）、单体型乙（T、G）和单体型丙（C、G）。通过关联分析证明，这三种单体型的纯合类型中，单体型甲或乙纯合的小麦，其千粒重显著高于单体型丙纯合的小麦；单体型甲纯合的小麦，其株高极显著低于单体型乙或丙纯合的小麦。本发明还提供了所述两个SNP的分子标记。实验证明，通过检测所述的两个SNP，即可找到千粒重较高、株高较矮的小麦。本发明为小麦的分子标记辅助选择育种提供了一个新方法，在培育高产矮杆小麦品种或研究中具有重要意义。