MassARRAY® SNP是基于质谱分析的基因分型工具,通过与MALDI-TOF-MS技术相结合,可实现高达40重的PCR反应和基因型检测,实验设计灵活,性价比高,特别适用于100个SNP以内的大量样本检测。
GWAS分析后期验证
精细定位
功能位点筛选和检测
基因身份证鉴定
品种鉴定
检测通量高:单次上机可达384样本,一天可检测几千样本。
操作简单:只需进行一次PCR反应,单管检测可达40多重。
周期短: 可在8小时完成从DNA到数据报告的转化。
分型灵敏度高: 使用相对少量的DNA即可实现低至0.1%的灵敏度。
成本低:前期投入低,试剂浪费少,无需荧光探针等修饰。
检测原理
MassARRAY结合了简单可靠的引物延伸和先进的MALDITOF质谱技术,直接检测分子量,简单清晰的生信分析和多重PCR极大的降低运行和样品成本,性价比极其出众。高效迅速的实验流程可以对95%以上的已被证实的SNP进行实验设计。
检测结果
注:橙色,蓝色表示纯合样本,绿色表示杂合样本
案例一:精细定位
精细定位使用MassARRAY对区间中的SNP标记进行分型,分型快速高效、省时省力、经济实惠。
案例二:基因身份证开发
利用MassARRAY检测品种特有SNP标记,高效快速、成本低,康普森已与宁夏盐池县委县政府合作开发盐池滩羊“基因身份证”,利用基因科技保障品牌市场、提升品牌价值。
[1] Wang Z, Chen Q, Wang Y, Wang Y, Liu R. Refine localizations of functional variants affecting eggshell color of Lueyang black-boned chicken in the SLCO1B3. Poult Sci. 2024;103(1):103212. doi:10.1016/j.psj.2023.103212
应用方向:MassARRAY平台验证略阳乌骨鸡蛋颜色功能变异相关的SNP标记。
[2] JiX,CaoZ, HaoQ, et al. Effects of New Mutations in BMPRIB, GDF9, BMP15, LEPR, and B4GALNT2 Genes on Litter Size in Sheep. Vet Sci. 2023;10(4):258. Published 2023 Mar 28. doi:10.3390/vetsci10040258
应用方向:MassARRAY平台验证绵羊产仔数相关的SNP标记。
[3] Ma Z, Wang W, Zhang D, et al. Polymorphisms of PLIN1 and MOGAT1 genes and their association with feed efficiency in Hu sheep. Gene. 2024;897:148072. doi:10.1016/j.gene.2023.148072
应用方向:MassARRAY平台验证湖羊饲料利用效率相关的SNP标记。
[4] Zhang R, Liu Y, Li W, et al. A mutation in LPAR2 activates the miR-939-5p-LPAR2-PI3K/AKT axis to regulate the proliferation and apoptosis of granulosacell sinsheep.Theriogenology. 2024;219:1-10. doi:10.1016/j.theriogenology.2024.02.010
应用方向:MassARRAY平台验证绵羊颗粒细胞的增殖和凋亡相关的SNP标记。
[5] Kushwaha AK, Ellur RK, Maurya SK, et al. Fine mapping of qBK1.2, a major QTL governing resistance to bakanae disease in rice. Front Plant Sci. 2023;14:1265176. Published 2023 Nov 10. doi:10.3389/fpls.2023.1265176
应用方向:MassARRAY平台验证水稻抗藤黑镰刀病相关的SNP标记。
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