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肝细胞癌 (HCC) 的特征是频繁的体细胞基因组拷贝数改变 (CNA)，其中大部分未在生物学上进行探索。

2021年8月25日，北京国家蛋白质科学中心，北京生命组学研究所，广西医科大学，南京医科大学等多单位合作，周钢桥及贺福初共同通讯在Science Advances 在线发表题为“Genomic gain of RRS1 promotes hepatocellular carcinoma through reducing the RPL11-MDM2-p53 signaling”的研究论文，该研究进行了将 CNA 与转录组数据相结合的综合分析，以揭示 CNA 在 HCC 中的顺式和反式效应。

该研究确定了染色体 8q 的反复基因组增益，其表现出强烈的反式效应，并且与核糖体生物发生活性广泛相关。此外，8q 增益驱动的核糖体生物发生调节剂 (RRS1) 的过表达促进了体外和体内 HCC 细胞的生长。从机制上讲，RRS1 通过将 RPL11 保留在核仁中来减弱核糖体应激，从而增强 MDM2 介导的 p53 泛素化和降解。在临床上，较高的 RRS1 表达水平预示着 HCC 患者的临床结果不佳，尤其是在 p53 完整的患者中。总之，该研究研究结果表明，染色体 8q 癌基因 RRS1 通过减弱 RPL11-MDM2-p53 通路促进 HCC 发展，并为治疗这种恶性肿瘤提供了新的潜在靶点。

另外，2020年7月9日，中国科学院上海药物研究所谭敏佳、国家癌症中心/中国医学科学院肿瘤医院肖汀、军事科学院军事医学研究院、国家蛋白质科学中心（北京）贺福初、上海交通大学李婧以及军事医学研究院、国家蛋白质科学中心（北京）汪宜共同通讯在Cell 在线发表题为“Integrative Proteomic Characterization of Human Lung Adenocarcinoma”的研究论文，该研究对103例中国患者的LUAD进行了全面的蛋白质组学分析。蛋白质组学，磷酸化蛋白质组学，转录组和全外显子组测序数据的综合分析显示了癌症相关的特征，例如肿瘤相关的蛋白质变体，独特的蛋白质组学特征以及早期患者或具有EGFR和TP53突变的患者的临床结局。基于蛋白质组的LUAD分层显示了与不同的临床和分子特征相关的三种亚型（S-I，S-II和S-III）。此外，该研究提名了潜在的药物靶标并验证了HSP90β的血浆蛋白水平是独立队列中LUAD的潜在预后生物标志物。该研究的综合蛋白质组学分析可以更全面地了解LUAD的分子结构，并为更精确的诊断和治疗提供机会（点击阅读）。

肝细胞癌 (HCC) 是全球第六大最常见的癌症，也是全球第二大最致命的癌症。 HCC 最重要的危险因素仍然是乙型肝炎病毒和丙型肝炎病毒感染、黄曲霉毒素 B 暴露、饮酒、先天性代谢疾病和糖尿病。尽管现代医学的发展和各种治疗策略的联合使用改善了 HCC 患者的预后，但这种恶性肿瘤的长期预后仍然有限。

遗传改变的连续积累被认为是 HCC 发生和进展的因素。尽管在表征与 HCC 相关的分子畸变的基因组景观方面取得了进展，但可靶向的生物依赖性仍然难以捉摸且表征不佳。除了临床上不可操作的最常见突变（例如，TERT 启动子、CTNNB1 和 p53 中的突变）外，HCC 在突变水平上表现出高度的肿瘤间和肿瘤内异质性。影响癌症基因组中癌基因或肿瘤抑制基因的复发性拷贝数改变 (CNA) 可能代表选择下的基本肿瘤成瘾。据报道，几个癌症驱动基因反复受到 CNA 的影响 ，例如 HCC 中的 CDKN2A 缺失和 FGF19 扩增。

染色体 8q 增益是许多类型肿瘤的共同特征。除了在 HCC 患者中的高发生率 之外，在其他几种癌症中也经常观察到染色体 8q 的增加，包括卵巢癌、原发性生殖细胞肿瘤、黑色素瘤、子宫内膜癌、透明细胞肾细胞癌、胃腺癌和肺腺癌。此外，8q 的增加与透明细胞肾细胞癌的存活率低和前列腺癌的肿瘤复发相关。

众所周知，染色体 8q 含有涉及多种肿瘤类型的重要癌基因，包括乳腺癌的 MTDH和众所周知的癌基因 MYC。然而，这种染色体改变影响了广泛的基因组区域，这限制了对所涉及的致癌机制的理解。缺乏局灶性扩增支持了以下观点，即染色体 8q 上的多个驱动因素可能导致癌症患者的不良临床结果。8q 关键癌症相关基因的鉴定可能提供潜在的治疗靶点，并为这些无法从当前治疗中受益的患者提供精准治疗。

在这里，该研究进行了综合组学分析，同时考虑到 HCC 中的全基因组拷贝数景观和转录组数据。该研究发现臂水平 CNA 对 HCC 中一般基因表达的广泛反式效应的证据，其中染色体 8q 增益是主要贡献者。鉴于 8q 增益与核糖体生物发生活性的强关联，该研究将核糖体生物发生调节蛋白 RRS1 鉴定为参与 HCC 进展的关键癌基因。该研究进一步剖析了 RRS1 在调节 RPL11-MDM2-p53 通路中的致癌作用的潜在机制。这些结果突出了 RRS1 作为多种癌症中 8q 增益的功能靶点，这可能是治疗靶向的。

参考消息：

http://advances.sciencemag.org/content/7/35/eabf4304