来源：iPlants

近日，南京林业大学生物与环境学院朱福远教授团队在无标记质谱采集模式技术研究领域取得突破，相关科研成果分别在Cell子刊《Trends in Plant Science》（影响因子：14.416）和生物技术类权威期刊《Trends in Biotechnology》（影响因子：14.343）上发表了题为“Quantifying plant dynamic proteomes by SWATH-based mass spectrometry”“SWATH-MS-Based Proteomics: Strategies and Applications in Plants”的研究论文。朱福远教授分别为论文的第一作者和第一通讯作者，南京林业大学为第一作者单位。

SWATH的全称是“sequential window acquisition of all theoretical spectra”，是一项全新的无标记质谱采集模式技术。它能够对复杂样品中几乎所有可检测的分子进行定量测定，相较于传统的Shotgun、SRM、标记类蛋白质组等技术具有高通量、高灵敏性、可重复性和低成本等特点。朱福远教授团队通过优化植物蛋白提取方案（兼顾可溶性与非可溶性蛋白）和基于质谱技术的数据采集策略（保证低丰度蛋白的检测），首次成功将SWATH-MS应用到植物科学研究中，取得了一系列原创性成果。此次发表的系列论文分别详细阐述了SWATH-MS的基本原理与实验流程，并提出了若干提高该技术在植物领域应用效率的具体办法，将该技术进一步拓宽到多维度热点应用场景中如高通量筛选植物互作蛋白与修饰蛋白、可变剪接转录本的蛋白层面鉴定、无参考基因组植物的蛋白组分析、植物蛋白修饰组学、植物样品大队列分析等，并展望了该技术的优势与挑战，对于推动该项技术在组学领域科研服务市场的普及与推广，具有广阔的市场应用前景。

上述研究得到国家自然科学基金、南京林业大学标志性成果培育项目以及江苏省高校优势学科建设工程项目的资助。